De Missie van Stichting Waterlelie Fonds is als volgt vastgelegd (Statuten, artikel 2 lid 1):
De stichting heeft ten doel:
- Kleinschalige en directe hulp te bieden aan hulpbehoevende individuen en groepen in ontwikkelingslanden, met name Indonesië, via lokale contactpersonen. De nadruk zal liggen op armoedebestrijding, het verstrekken van basisfaciliteiten en de ondersteuning van slachtoffers van mensenrechtenschending.
- Het financieel steunen van projecten, buiten Stichting Waterlelie Fonds om, gericht op armoedebestrijding, het verstrekken van basisfaciliteiten en/of de ondersteuning van slachtoffers van mensenrechtenschending.
- Het verrichten van alle verdere handelingen, die met het vorenstaande in de ruimste zin verband houden of daartoe bevorderlijk kunnen zijn.
De missie is lijkt vrij breed en is ook vrij breed omschreven. Met een dergelijke missie kun je veel kanten op. Dat is ook de bedoeling! Het Waterlelie Fonds wil NIET meer geld besteden aan statutaire wijzingen, papieren rompslomp en dergelijk kosten dan noodzakelijk.
Het Waterlelie Fonds gelooft in de kracht van mensen. Wij gaan niemand "blijvend" verwennen, omdat wij ervan overtuigd zijn dat mensen zichzelf kunnen redden als ze zich niet voortdurend druk hoeven te maken om zich in de basisvoorzieningen te kunnen voorzien. Iedereen heeft in onze ogen "recht" op gelijke kansen. Kinderen kunnen zich onmogelijk ontwikkelen als zij fulltime moeten werken voor de kost.